DNBSEQ-T7平台
平台介绍
2022年3月,格致博雅引入超高通量测序仪DNBSEQ-T7,日产出高质量数据1-7T,广泛适用于全基因组测序、表观基因组测序、转录组测序等大型测序项目。借助该平台高速、灵活、超高通量的显著优势,更好地释放公司强大的数据分析和数据交付能力,打造值得信赖的基因大数据服务平台。
平台优势
更极致的测序周期
(48小时极致周期测序服务)
更严格的质控标准和更高的数据质量
(平均Q30达到95以上)
更好的服务态度
(提出问题10分钟响应)
智能交付流程
拥有自动化设备与数据下机管理系统ZTRON
ZLIMS,ZLIMS实验室信息管理系统,记录实验过程数据,监控仪器样本的实时状态,对下机数据进行存储管理,可集成信息分析平台,形成从样本录入到最终报告的全套产品组合。
基因组测序智能交付流程
送样建议
1. 核酸送样要求
建库类型 |
|
样品总量要求(单次建库) |
RNA 文库类型 |
普通转录组/真核链特异性 |
m≥1μg,RIN≥6.8(动物)、6.3(植物、真菌),基线平整 (软体等无 28S 物种) |
原核转录组 |
m≥3μg,RIN≥6 |
small RNA |
m≥3μg,RIN≥7.5(动物)、7(植物、真菌),基线平整 (软体等无 28S 物种) |
LncRNA |
m≥2μg,RIN≥6.8(动物)、6.3(植物、真菌),基线平整 (软体等无 28S 物种) |
宏转录组 |
m≥2.5μg,RIN≥6.5 |
M6A |
m≥15μg,浓度≥20 ng/μl,RIN≥7.5,基线平整 |
DNA 文库类型 |
小片段文库 |
动植物基因组:m≥0.5μg |
小基因组(叶绿体/线粒体 DNA): m≥0.8μg |
小基因组(叶绿体/线粒体 DNA): m≥0.8μg |
<500bp PCR 产物:m≥0.2μg |
≥500bp PCR 产物:m≥1μg |
全基因组 DNA 甲基化文库 |
基因组大小≤1.5G: m≥3μg |
ChIP-seq 文库 |
m≥20ng |
RAD 文库 |
m≥1μg |
meta 文库 |
m≥0.8μg |
外显子文库 |
m≥0.5μg |
2. 组织送样要求
物种分类 |
部位 |
建议送样量 |
植物 |
根 |
常规材料≥500mg,特殊材料≥1g |
茎 |
叶 |
花 |
果实/种子 |
幼苗 |
动物 |
组织 |
常规材料≥200mg,特殊材料≥500mg |
细胞 |
≥2*106细胞 |
全血(用于提取 RNA) |
全血≥4 ml |
全血(用于提取 DNA) |
哺乳动物全血≥400ul, 鸟类,鱼类≥100ul; |
测序质量
测序平台 |
测序策略 |
产出 |
交付周期 |
DNBSEQ-T7 |
PE150 |
1.75Tb~7Tb |
自建库:7个工作日 建库测序:15个工作日 (500个样本以内) |
PE100 |
1.16Tb~4.64Tb |