信息分析类型 | 信息分析内容 | |
标准信息分析 | 测序评估(碱基含量分布、测序质量分布及统计)比对 比对统计(统计比对率、基因组覆盖度、测序深度等)SNP检测、注释及统计 | |
InDel 检测、注释及统计 SV检测、注释及统计 CNV检测、注释及统计 |
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高 级 信 息 分 析 |
群体进化 | 连锁不平衡分析(LD) 群体进化树分析(Phylogeny tree) 群体结构分析(Structure) 群体主成分分析(PCA) 多态性分析(Pi) 选择消除分析 群体历史研究(有效群体大小和有效群体分歧时间) |
全基因组关联分析(GWAS) | 连锁不平衡分析(LD) 群体主成分分析(PCA) 性状关联分析 目标性状相关区域基因功能注释 构建单倍型图谱 |
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全基因组选择分析(GS) | 连锁不平衡分析(LD) 群体主成分分析(PCA) 性状关联分析 育种值计算 全基因组选择分析 |
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品种鉴定/ 亲缘关系鉴定 |
群体结构分析(Structure) 群体主成分分析(PCA) 品种鉴定分析 亲缘关系分析 |
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数据库构建 | 基于客户需求完成个性化数据库搭建 | |
个性化信息分析 | 可结合客户的需求,协商确定个性化信息分析内容 |
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