从头测序即denovo测序, 不需要任何参考序列资料即可对某个物种进行测序,用生物信息学分析方法进行拼接、组装,从而获得该物种的基因组序列图谱。利用全基因组从头测序技术,可以获得动植物的全基因组序列,带动这个物种下游一系列研究的开展,从而推进该物种的研究。全基因组序列图谱完成后,可以构建该物种的基因组数据库,为该物种的后基因组学研究搭建一个高效的平台,为后续的基因挖掘、功能验证提供DNA序列信息。我们结合短读长和长读长测序技术,可以高效、低成本地完成所有物种的基因组序列图谱。
测序平台 | 文库类型 | 样品类型 | 样品浓度 | 样本量 |
Nanopore | 20 Kb | 基因组DNA | 20 ng/μl | 10 μg |
PacBio | 20 Kb | 20 ng/μl | 10 μg | |
DNBSEQ | 350 bp | 20 ng/μl | 1.5 μg | |
Hi-C | -- | 完成甲醛交联的DNA/新鲜血液/活体组织 | -- | -- |
注:大片段文库不建议客户送DNA样本,建议直接送组织:组织样本需求量依据不同物种及组织样本类型而不同,如有需要请咨询当地销售。
测序平台 | 文库大小 | 测序读长 | 推荐测序深度 | 主要用途 |
PacBio | 20 Kb及以上 | 10 Kb及以上 | 100X/30X | 组装 |
Nanopore | 20 Kb及以上 | 10 Kb及以上 | 120X | 组装 |
DNBSEQ/Nova | 350bp | PE150 | 50-100X | Survey/纠错 |
Hi-C | 250-450bp | PE100/PE150 | 100X | Hi-C辅助组装定位 |
注:表中提及的组装手段可根据物种特性及技术特点进行选择。
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