动植物基因组denovo

产品概述

从头测序即denovo测序, 不需要任何参考序列资料即可对某个物种进行测序,用生物信息学分析方法进行拼接、组装,从而获得该物种的基因组序列图谱。利用全基因组从头测序技术,可以获得动植物的全基因组序列,带动这个物种下游一系列研究的开展,从而推进该物种的研究。全基因组序列图谱完成后,可以构建该物种的基因组数据库,为该物种的后基因组学研究搭建一个高效的平台,为后续的基因挖掘、功能验证提供DNA序列信息。我们结合短读长和长读长测序技术,可以高效、低成本地完成所有物种的基因组序列图谱。

产品应用

技术流程

样本要求

测序平台 文库类型 样品类型 样品浓度 样本量
Nanopore 20 Kb 基因组DNA 20 ng/μl 10 μg
PacBio 20 Kb 20 ng/μl 10 μg
DNBSEQ 350 bp 20 ng/μl 1.5 μg
Hi-C -- 完成甲醛交联的DNA/新鲜血液/活体组织 -- --

注:大片段文库不建议客户送DNA样本,建议直接送组织:组织样本需求量依据不同物种及组织样本类型而不同,如有需要请咨询当地销售。

测序策略

测序平台 文库大小 测序读长 推荐测序深度 主要用途
PacBio 20 Kb及以上 10 Kb及以上 100X/30X 组装
Nanopore 20 Kb及以上 10 Kb及以上 120X 组装
DNBSEQ/Nova 350bp PE150 50-100X Survey/纠错
Hi-C 250-450bp PE100/PE150 100X Hi-C辅助组装定位

注:表中提及的组装手段可根据物种特性及技术特点进行选择。

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