全基因组de novo
产品介绍
从头测序即denovo测序, 不需要任何参考序列资料即可对某个物种进行测序，用生物信息学分析方法进行拼接、组装，从而获得该物种的基因组序列图谱。利用全基因组从头测序技术，可以获得动植物的全基因组序列，带动这个物种下游一系列研究的开展，从而推进该物种的研究。全基因组序列图谱完成后，可以构建该物种的基因组数据库，为该物种的后基因组学研究搭建一个高效的平台，为后续的基因挖掘、功能验证提供DNA序列信息。我们结合短读长和长读长测序技术，可以高效、低成本地完成所有物种的基因组序列图谱。
技术流程
平台优势
（1）平台可选：同时具备三代测序平台PacBio 与 Nanopore，可以实现对动植物基因 组进行长读长、高精度的测序。
（2）分析完善：可结合短读长和长读长数据，以及 Hi-C 数据，以获得更全面的基因组结构信息。同时具有完善的方案用于评估组装的完整性和准确性，并与已知的参考 基因组进行比较。
（3）经验丰富：具有丰富的基因组组装经验，助力客户在多个国际高水平期刊发表高分文章。
样本要求
1. 核酸送样要求
| 测序平台 | 文库类型 | 样品类型 | 样品浓度 | 样本量 |
| Nanopore | 20 Kb | 基因组DNA | 20 ng/μl | 10 μg |
| PacBio | 20 Kb | 20 ng/μl | 10 μg | |
| DNBSEQ | 350 Kb | 20 ng/μl | 1.5 μg | |
| Hi-C | -- | 完成甲醛交联的DNA/新鲜血液/活体组织 | -- | -- |
注：大片段文库不建议客户送DNA样本，建议直接送组织：组织样本需求量依据不同物种及组织样本类型而不同，如有需要请咨询当地销售。
测序策略
| 测序平台 | 文库大小 | 测序读长 | 推荐测序深度 | 主要用途 |
| Nanopore | 20 Kb及以上 | 10 Kb及以上 | 100X/30X | 组装 |
| PacBio | 20 Kb及以上 | 10 Kb及以上 | 120X | 组装 |
| DNBSEQ | 350 Kb | PE150 | 50-100X | Survey/纠错 |
| Hi-C | 250-450bp | PE100/PE150 | 50-100X | Hi-C辅助组装定位 |
注：表中提及的组装手段可根据物种特性及技术特点进行选择。
