种群进化通过全基因组重测序技术获得某物种自然群体各亚群的基因组信息，通过与参考基因组比对，得到大量高准确性的 SNP、InDel、SV、CNV 等变异信息，然后基于群体变异信息，讨论群体的遗传结构、基因交流情况、物种形成机制以及群体进化动态等生物学问题，从而从分子层面深入研究该物种的进化历程。基于全基因组重测序的群体进化研究，能够有效地挖掘出群体内的遗传变异，可用来追溯群体的进化过程，挖掘进化基因，已广泛应用于许多物种的人工驯化机制研究、自然选择机制分析和种群历史研究。具有重要的科学理论和实践应用价值。

1	SNP/CNV检测、注释及统计
2	群体多态性分析
3	连锁不平衡分析（LD）
4	驯化相关基因
5	群体历史分析
6	基因交流分析