GLcWGSTM平台
产品介绍
全基因组低深度重测序（low-coverage whole-genome sequencing, LcWGS）是继简化基因组测序之后新一代低测序成本的标记开发方法。一般认为其测序深度在1×以下，该策略首先对群体中所有个体进行全基因组低深度重测序和变异查找，之后根据SNP位点间的连锁不平衡（linkage disequilibrium, LD）对缺失基因型进行推断和基因型填充（genotypeimputation），最终获取大规模样本全基因组水平的高密度遗传标记。
技术流程
平台优势
高覆盖度：
采用自主建库方式，1X测序基因组覆盖度可达58%
高准确度：
与芯片金标准相比，基因分型准确率可达到99%
高性价比：
低测序成本获得高密度高准确度标记
高时效性：
兼容所有版本芯片的有效位点，即测即用，不需前置设计
应用场景
LcWGS能够以较低成本准确获取全基因组遗传变异，更有利于动植物遗传育种研究与应用。
群体分析：
解析群体结构及其变化规律，群体遗传分析；
位点挖掘：
挖掘与性状紧密关联的位点，尤其是经济性状位点；
基因选择：
建立预测模型，分析基因组的育种值，获取高育种值材料；
基因编辑：
给基因编辑提供素材，人为“改良”或“重塑”物种；
智能育种：
筛选出有利的等位基因组合，进行品种选育、遗传改良；
Ref panel：
提供高密度的单倍体参考版，丰富种群数据库，建立数据信息共享；
服务优势
丰富的育种研究经验；
专业的技术操作人员；
性能优异的自动化建库和测序平台；
高效专业的生物信息团队；
