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PacBio Revio平台
平台介绍 平台优势 送样建议
平台介绍
PacBio Revio是由Pacific Biosciences 公司推出的一款革命性的长读长测序系统,它通过显著提高HiFi数据的通量和降低成本,使得高质量的长读长测序技术更加普及和经济。Revio系统采用了高密度的SMRT Cell芯片,能够并行运行多个样本,每天产生高达360 Gb的HiFi数据,相当于每年可以测序1300个人类全基因组。它还集成了先进的NVIDIA GPU,提高了计算能力,并且通过深度学习算法,如Google Health的DeepConsensus,进一步提升了测序的准确度和产量。
平台优势
长读长
长读长:HiFi 测序技术可以产生平均读长达到数十千碱基(Kb)的序列数据,远超过传统的短读长测序技术。
高准确度
碱基准确度非常高,Q值通常达到Q30或以上。
直接甲基化检测
能够在测序过程中直接检测 DNA 的甲基化状态,对表观遗传学研究非常重要。
高通量
可以在单次测序运行中产出大量的数据,适合大规模的基因组学研究。
送样建议
1. 核酸送样要求
建库类型 样品要求
三代RNA文库 m≥15μg;RIN≥7
三代DNA文库 昆虫、植物及海洋生物 m≥30μg;主带大小:≥40kb
其他样品:DNA 浓度≥100ng/ul,总量≥15ug(测序 2cells)或≥10ug (测序 1cell);主带大小:≥40kb
2. 组织送样要求
物种分类 部位 建议送样量 目标提取量
植物 常规材料≥5g,特殊材料≥10g ≥10ug
≥10ug
≥10ug
≥10ug
果实/种子 ≥10ug
幼苗 ≥10ug
动物 组织 常规材料≥2g,特殊材料≥5g ≥10ug
细胞 ≥2*107细胞 ≥10ug
全血 哺乳动物全血≥5 ml , 鸟类,鱼类≥1 ml; ≥10ug
主要注意事项如下:
新鲜材料现用现取;植物材料务必选取幼嫩组织,特别是高糖高酚材料和油质叶片材料;需冷冻材料务必先液氮速冻再-80℃冷冻,不可离体后直接-80℃保存,不可-20℃保存;保存时间建议不超过半年;不可使用保存液或乙醇保存。