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基因编辑产品安全评价
基因编辑产品安全评价
产品介绍

基因编辑植物,是指利用基因编辑技术对基因组特定位点进行靶向修饰获得的,用于农业生产或农产品加工的植物及其产品。2012年CRISPR-Cas基因编辑技术取得重大突破后,便在全球农作物品种改良和粮食安全方面发挥着重要的作用,广泛应用于基因功能研究、模式动物构建、基因治疗等方向。与所有新出现的生物科技相同,CRISPR-Cas基因编辑技术投入实践后也不断在世界各地引起科学、舆论和法律等方面的争议。尽管有足够的科学实验表明,CRISPR-Cas基因编辑技术在脱靶风险上是可控的,但是公众对于基因相关的技术一直存有怀疑情绪。因此最为基础的、也是最引人关切的问题便是CRISPR-Cas基因编辑农作物的安全性评估。

2022年,农业农村部发布了《农业用基因编辑植物安全评价指南(试行)》,其亮点是把基因编辑定义为“利用基因工程技术对基因组特定位点进行靶向修饰获得的,用于农业生产或农产品加工的植物及其产品”,将“引入外源基因的基因编辑植物”排除了适用范围。说明我国在法律层面上承认了基因编辑作物的独特性,把基因编辑与转基因进行区分,并根据基因编辑作物的自身特点,推出适合其性质的安全评估与申报的规定。

格致博雅基因编辑安全评价检测分析服务,基于全基因组技术对CRISPR基因编辑产品进行分析,能更高效完成基因编辑植物靶基因编辑情况检测、载体残留检测、脱靶位点检测,在保证安全的前提下为开发者减轻责任负担,助力农作物产量和品质改良。

技术路线
分析内容

靶基因编辑情况检测:根据 sgRNA 在基因组上的物理位置,对该区域进行 SNP 和 indel 检测,重点关注 PAM 上游的变异情况。

脱靶位点检测:使用 Cas-Offinder 软件,基于与 sgRNA 序列同源性的算法进行全基因组范围内的 CRISPRCas 脱靶位点预测,对预测到的潜在脱靶位点进行变异检测。通过比较编辑样本和对照样本的位点 差异,找到真实脱靶位点。

载体序列残留检测:将测序数据比对到载体序列上,通过覆盖度比例判断是否有载体残留。

案例展示

对某编辑材料进行高深度测序后,根据sgRNA在基因组上的物理位置,对该区域进行SNP 和indel检测,分析编辑位点情况,从而判断是否成功编辑。

格致博雅提供基于全基因组技术的基因编辑安全评价检测分析服务,涵盖脱靶效应、载体残留和靶基因编辑情况检测。服务精准可靠,符合法规要求,帮助农作物产量和品质改良,减轻开发者责任负担,增强消费者信心。