·上机策略
Thermo Q Exactive™ HFX/Orbitrap Exploris 480 系统。
·基本信息分析内容
1.质谱分析参数、鉴定结果以及数据质控结果；
2.蛋白质鉴定结果（Unique肽段数分析；肽段长度分析；蛋白覆盖度分析；母离子质量容差分布）；
3.蛋白质功能分析（GO功能注释；KEGG功能注释；COG功能注释）；
·上机策略
Thermo Q Exactive™ HFX/Orbitrap Exploris 480系统10个馏分;
TMT：每馏分1.5h高精度质谱分析;
iTRAQ：每馏分1h高精度质谱分析。
·基本信息分析内容
1.质谱分析参数、鉴定结果以及数据质控结果；
2.总蛋白质的功能注释（GO功能注释、KEGG功能注释、COG功能注释、蛋白结构域注释、亚细胞定位分析）;
3.蛋白定量分析结果;
4.差异表达蛋白的筛选结果（火山图分析、聚类热图分析、C-means分析）;
5.差异表达蛋白的功能富集分析（GO富集分析、KEGG富集分析、结构域富集分析、差异蛋白亚细胞定位分析）;
6.差异表达蛋白互作网络分析。
·上机策略
Thermo Q Exactive™ HFX/Orbitrap Exploris 480 系统
混样上机，建DDA文库，默认4个馏分，1.5h高精度质谱分析；
单个样本分别采用DIA方式上机，默认单个馏分，1.5h高精度质谱分析。
·基本信息分析内容
1.质谱分析参数、鉴定结果以及数据质控结果;
2.总蛋白质的功能注释（GO功能注释、KEGG功能注释、COG功能注释、蛋白结构域注释、亚细胞定位分析）;
3.蛋白定量分析结果;
4.差异表达蛋白的筛选结果（火山图分析、聚类热图分析、C-means分析）;
5.差异表达蛋白的功能富集分析（GO富集分析、KEGG富集分析、结构域富集分析、差异蛋白亚细胞定位分析）;
6.差异表达蛋白互作网络分析。
·上机策略
Thermo Q Exactive™ HFX/Orbitrap Exploris 480系统;
混样上机，建DDA文库，默认4个馏分，1.5h高精度质谱分析;
单个样本分别采用DIA方式上机，默认单个馏分，1.5h高精度质谱分析。
·基本信息分析内容
1.质谱分析参数、鉴定结果以及数据质控结果;
2.总蛋白质的功能注释（GO功能注释、KEGG功能注释、COG功能注释、蛋白结构域注释、亚细胞定位分析）;
3.蛋白定量分析结果;
4.差异表达蛋白的筛选结果（火山图分析、聚类热图分析、C-means分析）;
5.差异表达蛋白的功能富集分析（GO富集分析、KEGG富集分析、结构域富集分析、差异蛋白亚细胞定位分析）;
6.差异表达蛋白互作网络分析。
·上机策略
Thermo Q Exactive™ HFX/Orbitrap Exploris 480 系统
·基本信息分析内容
1.质谱分析参数、鉴定结果以及数据质控结果;
2.蛋白质鉴定结果（Unique肽段数分析；肽段长度分析；蛋白覆盖度分析；母离子质量容差分布）;
3.蛋白质功能分析（GO功能注释；KEGG功能注释；COG功能注释）。
·上机策略
Thermo Q Exactive™ HFX/Orbitrap Exploris 480 系统
富集方法：IMAC-Fe 磷酸化肽段富集
·基本信息分析内容
1.质谱分析参数、鉴定结果以及数据质控结果;
2.总修饰蛋白质的功能注释（GO功能注释、KEGG功能注释、COG功能注释、蛋白结构域注释、亚细胞定位分析）;
3.修饰蛋白定量分析结果;
4.修饰位点个数、种类、分布位置统计;
5.motif分析;
6.差异修饰位点筛选;
7.差异表达的修饰蛋白筛选结果（火山图分析、聚类热图分析、C-means分析）;
8.差异修饰蛋白的功能富集分析（GO富集分析、KEGG富集分析、结构域富集分析、差异蛋白亚细胞定位分析）;
9.差异修饰蛋白互作网络分析。
·上机策略
Thermo Q Exactive™ HFX/Orbitrap Exploris 480 系统
富集方法：乙酰化和泛素化采用CST进口抗体富集，N-糖基化采用HILIC富集
·基本信息分析内容
1.质谱分析参数、鉴定结果以及数据质控结果;
2.总修饰蛋白质的功能注释（GO功能注释、KEGG功能注释、COG功能注释、蛋白结构域注释、亚细胞定位分析）;
3.修饰蛋白定量分析结果;
4.修饰蛋白定量分析结果;
5.motif分析;
6.差异修饰位点筛选;
7.差异表达的修饰蛋白筛选结果（火山图分析、聚类热图分析、C-means分析）;
8.差异修饰蛋白的功能富集分析（GO富集分析、KEGG富集分析、结构域富集分析、差异蛋白亚细胞定位分析）;
9.差异修饰蛋白互作网络分析。
意向联系：support@glbizzia.com
